Visiopharm 多重表型分析软件
型号：Multiplex Phenotyping面对 40 个以上标志物的多重免疫荧光图像，人工判读既慢又难复现。Visiopharm 多重表型分析模块用深度学习做细胞分割，把高维信号自动聚类成有生物学意义的表型，再用 t-SNE、热图和邻域矩阵回答"哪类细胞多、谁和谁挨着"。支持 H&E、单标与多标 IHC、多重 IF 及 IMC，可导入 200 个以上图像层。
核心参数
| 支持染色 | H&E、单标 IHC、多重 IHC、多重 IF、IMC（金属标签成像） |
|---|---|
| 通道支持 | 所有免疫荧光模式，200 个以上通道 |
| 图像层 | 可导入 200 个以上图像层，层名自动迁移 |
| 高多重能力 | 支持 40 个以上标志物同时分析，实测可达 50 通道 |
| 细胞分割 | 基于 DAPI / Hoechst / Iridium 核染通道的深度学习分割 |
| 表型识别 | 强度阈值结合分割结果自动聚类，可手动合并与重定义 |
| 强度归一化 | 多通道带强度归一化，消除染色批次与曝光差异 |
| 可视化 | t-SNE 图、标志物热图、表型矩阵、表型谱、邻域矩阵 |
| 空间分析 | 邻域矩阵量化表型之间的空间邻近与互作关系 |
| 数据导出 | .csv / .tsv 标准格式，可接 R、Python 统计流程 |
| 成像兼容 | Akoya Vectra 3 多光谱、Fluidigm Hyperion（IMC）、Ultivue 试剂盒 |
| 即用型应用 | 120 个以上 RUO 分析应用，7 个 CE-IVD 应用 |
| 部署方式 | 工作站、服务器或网络（Workstation / Cloud / Network） |
产品特点
- 40 个以上标志物同屏分析：人工判读在高维数据前既慢又不可复现，自动聚类给出统一判断标准
- 深度学习细胞分割：以 DAPI 或 Iridium 核染通道为基准，对强度、大小、形态差异稳健，细胞密集成团也能分开
- 绝对阈值与相对阈值并存：每个通道可独立设置，跨批次样本比较不再依赖肉眼调窗
- 强度归一化前置于聚类：先归一化再分型，消除染色批次与曝光差异造成的假阳性表型
- 表型自动聚类 + 人工校正：自动给出分组，也允许研究者按生物学意义合并、重命名与重定义
- 五大可视化组件：t-SNE、标志物热图、表型矩阵、表型谱、邻域矩阵，从降维到空间关系一次看全
- 空间邻近分析：回答"CD8+ T 细胞离 Treg 有多近"，这是只有基于原图才能算的关系
- 开放数据出口：结果导出 csv / tsv，直接接入 R、Python 或既有生信流程
- 兼容主流高多重平台：Akoya Opal 多标、IMC 金属标签、Ultivue 试剂盒均可接入
- 科研与临床研究两套基础：120 个以上 RUO 应用、7 个 CE-IVD 应用，覆盖探索与合规场景
适用场景
- 肿瘤微环境：免疫细胞亚群构成、空间分布与细胞间互作
- 肿瘤免疫治疗：疗效预测、应答与非应答人群的差异分析
- 生物标志物发现：高维表型筛选与候选标志物验证
- 药物研发：靶点表达谱、药效学与耐药机制研究
- 慢性肝病：肝内巨噬细胞表型谱在 HCV、NASH、自身免疫性肝炎中的差异
- 方法学研究：多标 IHC / IF 定量流程的标准化与可复现性验证